Das Generalsekretariat unterstützt den Vorsteher des Präsidialdepartements und leitet die Departementsangelegenheiten. Es knüpft und pflegt die Kontakte des Präsidialdepartements mit Personen und Institutionen aus Gesellschaft, Wirtschaft und Politik und unterstützt mit zentralen Stabsleistungen die Dienststellen des Departements.
Die Staatskanzlei unterstützt den Regierungsrat dabei, seine Regierungstätigkeit politisch und verwaltungstechnisch einwandfrei abzuwickeln. Sie ist ausserdem für die Kommunikation des Regierungsrates zuständig und ermöglicht so allen interessierten Kreisen, an der Politik des Regierungsrates teilzuhaben.
Die Abteilung Aussenbeziehungen und Standortmarketing pflegt die Kooperationen des Kantons und sorgt für eine koordinierte und wirksame Vermarktung von Basel.
Die Abteilung Gleichstellung von Frauen und Männern fördert die Gleichstellung und Chancengleichheit von Frauen und von Männern in allen Lebensbereichen.
Die Kantons- und Stadtentwicklung erarbeitet Szenarien und Strategien für eine nachhaltige Entwicklung von Stadt und Kanton. Dazu gehört auch die Arbeit der Fachstellen Stadtteilentwicklung, Stadtwohnen, Diversität und Integration sowie Gleichstellung von Menschen mit einer Behinderung.
Die Abteilung Kultur unterstützt kulturelle Institutionen, Projekte und freischaffende Künstlerinnen und Künstler. Sie setzt sich für die Schaffung von günstigen Rahmenbedingungen zur Entwicklung, Wahrung, Forschung, Sammlung und Vermittlung von professioneller Kultur ein. Zur Abteilung Kultur gehören fünf staatliche Museen, die Museumsdienste Basel, die Archäologische Bodenforschung und das Staatsarchiv.
Das Statistische Amt zeichnet dafür verantwortlich, dass regelmässig Daten zu verschiedenen Themen erhoben werden. Es erarbeitet Prognosen und veranlasst Bevölkerungsbefragungen.